La planificación estratégica del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), se enmarca en la Estrategia Española de Ciencia y Tecnología y de Innovación 2013-2020 y el Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2013-2016, así como en las directrices establecidas a través de la Comisión Mixta formada por representantes del Ministerio de Economía y Competitividad y el Ministerio de Sanidad, Servicios Sociales e Igualdad.
Para la implementación de dicha estrategia, el ISCIII dispone de los siguientes instrumentos:
- La Acción Estratégica en Salud, que se propone como una actuación programática en el marco del Programa Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2013-2016 y de cuyas actividades es órgano gestor.
- La política de Centros Propios, Fundaciones, Redes y Consorcios.
- Las Plataformas de Servicios y Científico Técnicas comunes.
- Los conciertos con las Comunidades Autónomas y otras instituciones.
Los objetivos básicos son:
- La generación de conocimiento en ciencias de la salud.
- La producción de un impacto positivo en la salud de la población.
- La generación de riqueza a través de la innovación y la creación de distintas iniciativas de tipo empresarial.
- El impulso del liderazgo internacional del Sistema Español de ciencia y Tecnología